创圣纪0011年的地球，由于11年前的大异变，人类丧失了2/3的人口 南极冰山溶化，1万2千年前灭亡的亚特兰蒂亚重现于世，拥有双翼的「堕天翅族」苏醒了。他们将生物机械兵器「神话兽」接连送入人类的都市，捕获人类，摄取生体能源「Purana」。 另一方面，人类决心反击，从海底遗迹发掘岀三台组合（hybrid）战斗机「Vector Machine」。这是1万2千年前，将堕天翅族逼入灭亡绝境的传说中的兵器...

时长半小时的短片故事是发生在TV版中途的番外篇，突出两位女主角的位置，并附带“歌姬”设定……主题曲延用TV版前半部的OP（但收录进剧场版时被取消）。...